Margarida Tomé é Professora Catedrática do Instituto Superior de Agronomia da Universidade de Lisboa, no qual coordena a linha de investigação ForChange (Modelação de ecossistemas florestais num contexto de alterações globais) do Centro de Estudos Florestais. É vogal do Conselho Nacional do Colégio de Engenharia Florestal na OE e tem ocupado diversos cargos em instituições internacionais: vice-chair do Board do European Forest Institute, vice-chair da IUFRO task force “Sustainable Planted Forests for a Greener Future”, coordenadora da Division 4.0 da IUFRO (International Union of Forest Research Organizations) (2005 – 2014), Scientific Advisory Board do European Forest Institute (2000 – 2004) e presidente do European Institute of Cultivated Forests (2002 – 2006).
Tem mais de 300 publicações, das quais 128 são em revistas internacionais e é, desde 2001, co-editora da série da Springer “Managing Forest Ecosystems”. Entre 2019 e 2022 foi também uma das Editoras da revista Forest Ecology and Management.